Жимулёв, Игорь Фёдорович

Игорь Фёдорович Жимулёв (род. 1 января 1947^[1] в г. Степанакерт, НКАО, Азербайджанская ССР (СССР)^[2]) — видный советский и российский учёный в области генетики, цитологии, доктор биологических наук (1982), профессор (1991), академик РАН (2006; член-корреспондент с 1997)^[3]. Лауреат Государственной премии Российской Федерации в области науки и техники. . Организатор и директорИМКБ СО РАН с 2011 г. Научный руководитель института (с 2017).

Закончил Горьковский (Нижегородский) государственный университет) им. Н.И. Лобачевского" в 1971 г. Работу в области генетики начал, выполняя дипломную работу в лабораториях Н. В. Тимофеева-Ресовского и Ж. А. Медведева в Институте медицинской радиологии АМН СССР (Обнинск), затем в лабораториях Н. П. Дубинина и А. П. Акифьева в Институте общей генетики АН СССР (Москва).

С 1971 года работал в Институте цитологии и генетики СО РАН, где с 1986 года возглавлял лабораторию молекулярной цитогенетики.

В 1993—2007 гг. читал курсы лекций по общей и молекулярной генетике и по организации хромосом на факультете естественных наук НГУ^[4].

С 2008 по 2017 год — член Президиума СО РАН.

С апреля 2009 по декабрь 2011 года — заместитель директора Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, заведующий отделом молекулярной и клеточной биологии на правах филиала в ИХБФМ СО РАН. Отдел был образован в результате перевода ряда исследовательских лабораторий ИЦиГ СО РАН в ИХБФМ СО РАН.

Заведующий лабораторией молекулярной цитогенетики Института молекулярной и клеточной биологии СО РАН^[2].

Создатель Института молекулярной и клеточной биологии СО РАН^[5], С декабря 2011 - директор -организатор, с 2012 - директор, с апреля 2017 года — научный руководитель ИМКБ СО РАН, с 2011 – по настоящее время – заведующий лабораторией молекулярной цитогенетики Института молекулярной и клеточной биологии СО РАН[2]

Основные области научных интересов: организация политенных хромосом, структура и экспрессия генов, гетерохроматин, структура и организация генома в иентерфазной хромосоме.

Автор более 350 публикаций, среди которых 3 монографии о политенных хромосомах, которые затем были переведены и изданы в США издательством Academic Press, а также четырех изданий учебного пособия для вузов «Общая и молекулярная генетика», а также статей в высокорейтинговых журналах (в частности PNAS, Science,Genome Research и др.) и, более 50 статей в журналe Chromosoma c 1974 по 2020 г.

Кроме того, И. Ф. Жимулёв занимается исследованием орнитофауны и экологии окрестностей Новосибирского Академгородка^[6], является участником проекта подсчета пернатых («Бёрдворчинг по-научному» ).^[7]

В 2006 г. выступил с активной критикой проектов новой застройки Академгородка (в частности, проекта технопарка), предполагавших массированную вырубку городских лесов^[8].

• Медаль ордена «За заслуги перед Отечеством» I степени (14 ноября 2022 года) — за вклад в развитие науки и многолетнюю добросовестную работу^[9]
• Медаль ордена «За заслуги перед Отечеством» II степени (11 марта 2008 года) — за достигнутые трудовые успехи и многолетнюю плодотворную работу^[10]
• Государственная премия Российской Федерации в области науки и техники 2002 года — за цикл работ «Организация генома и регуляция активности генов у эукариот»^[11] (Совместно с акад. Георгиевым П. Г., чл-корр Гвоздевым В. А., д.б.н. Пасюковой Е.Г., д.б.н. Головниным А.К., д.б.н. Беляевой Е.С., д.б.н. Семешиным В.Ф.))

• Жимулёв, Игорь Федорович. Политенные хромосомы: морфология и структура. — Новосибирск: Наука, 1992. — 478 с. — 400 экз. — ISBN 5-02-030073-X.
• Жимулёв, Игорь Федорович. Гетерохроматин и эффект положения гена. — Новосибирск: Наука, 1993. — 490 с. — ISBN 5-02-030131-0.
• Жимулёв, Игорь Федорович. Хромомерная организация политенных хромосом. — Новосибирск: Наука, 1994. — 564 с. — ISBN 5-02-030506-5.
• Шаблон:Zhimulev I.F. Morphology and structure of polytene chromosomes. Adv Genet 34, 1996, 497 p
• Шаблон:Zhimulev I.F. Heterochromatin and position effect variegation. Adv Genet 37, 1998, 566 p
• Шаблон:Zhimulev I.F. Genetic organization of polytene chromosomes. Adv Genet 39, 1999, 599 p
• Жимулёв, Игорь Федорович. Общая и молекулярная генетика : [Учеб. пособие для вузов]. — Новосибирск: Изд-во Новосиб. ун-та : Сиб. унив. изд-во, 2002. — 458 с. — 2000 экз. — ISBN 5-7615-0509-6.
• Жимулёв, Игорь Федорович. Общая и молекулярная генетика : учебное пособие для студентов университетов, обучающихся по направлению 510600 - Биология и биологическим специальностям. — 2-е, испр. и доп. — Новосибирск: Новосибирск : Сиб. унив. изд-во, 2003. — 478 с. — 2500 экз. — ISBN 5-94087-077-5.
• Жимулёв, Игорь Федорович. Природа Академгородка: 50 лет спустя. — Новосибирск: Издательство СО РАН, 2007. — 249 с. — 530 экз. — ISBN 978-5-7692-0950-5.
• Шаблон:Коряков Д.Е., Жимулев И.Ф. Хромосомы. Структура и функции.- Новосибирск: Изд-во СО РАН, 2009. - 258 с. - ISBN 978-5-7692-1045-7
• Жимулев, Игорь Федорович. Динамика экосистем Новосибирского Академгородка. — Новосибирск: Издательство СО РАН, 2013. — 437 с. — 300 экз. — ISBN 987-5-7692-1261-1..
• И.Ф. Жимулев, Н.Г. Андреенкова и др. Птицы Новосибирского Академгородка. — Новосибирск: Издательство СО РАН, 2014. — 437 с. — 320 экз. — ISBN 978-5-7692-1348-9..
• Жимулев, Игорь Федорович. Орнитофауна Новосибирского Академгородка. — Новосибирск: Издательство СО РАН, 2017. — 511 с. — 300 экз. — ISBN 978-5-7692-1548-3..

Наиболее значимые публикации в научных журналах: • Demakova OV, Demakov SA, Boldyreva LV, Zykova TYu, Levitsky VG, Semeshin VF, Pokholkova GV, Sidorenko DS, Goncharov FP, Belyaeva ES, Zhimulev IF. Faint gray bands in Drosophila melanogaster polytene chromosomes are formed by coding sequences of housekeeping genes. Chromosoma 129(1): 25-44, 2020 • Sidorenko DS, Sidorenko IA, Zykova TY, Goncharov FP, Larsson J, Zhimulev IF. Molecular and genetic organization of bands and interbands in the dot chromosome of Drosophila melanogaster. Chromosoma 128(2): 97-117, 2019 • Zykova TYu, Levitsky VG, Belyaeva ES, Zhimulev IF. Polytene chromosomes – a portrait of functional organization of the Drosophila genome. Curr Genomics 19(3): 179-191, 2018 • Pokholkova GV, Demakov SA, Andreenkov OV, Andreenkova NG, Volkova EI, Belyaeva ES, Zhimulev IF. Tethering of CHROMATOR and dCTCF proteins results in decompaction of condensed bands in the Drosophila melanogaster polytene chromosomes but does not affect their transcription and replication timing. PLoS ONE 13(4): e0192634, 2018 • Kolesnikova TD, Goncharov FP, Zhimulev IF. Similarity in replication timing between polytene and diploid cells is associated with the organization of the Drosophila genome. PLoS ONE 13(4): e0195207, 2018 • Andreyeva EN, Bernardo TJ, Kolesnikova TD, Lu X, Yarinich LA, Bartholdy BA, Guo X, Posukh OV, Healton S, Willcockson MA, Pindyurin AV, Zhimulev IF, Skoultchi AI, Fyodorov DV. Regulatory functions and chromatin loading dynamics of linker histone H1 during endoreplication in Drosophila. Genes Dev 31: 603-616, 2017 • Khoroshko VA, Levitsky VG, Zykova TY, Antonenko OV, Belyaeva ES, Zhimulev IF. Chromatin heterogeneity and distribution of regulatory elements in the late-replicating intercalary heterochromatin domains of Drosophila melanogaster chromosomes. PLoS ONE 11(6): e0157147, 2016 • Hoskins RA,... Demakova OV, Andreyeva EN, Boldyreva LV,... Zhimulev IF,... Celniker SE. The Release 6 reference sequence of the Drosophila melanogaster genome. Genome Res 25: 445-458, 2015 • Zhimulev IF, Zykova TYu, Goncharov FP, Khoroshko VA, Demakova OV, Semeshin VF, Pokholkova GV, Boldyreva LV, Demidova DS, Babenko VN, Demakov SA, Belyaeva ES. Genetic organization of interphase chromosome bands and interbands in Drosophila melanogaster. PLoS ONE 9(7): e101631, 2014 • Nordman JT, Kozhevnikova EN, Verrijzer CP, Pindyurin AV, Andreyeva EN, Shloma VV, Zhimulev IF, Orr-Weaver TL. DNA copy-number control through inhibition of replication fork progression. Cell Reports 9: 841–849, 2014 • Andreyenkova NG, Kolesnikova TD, Makunin IV, Pokholkova GV, Boldyreva LV, Zykova TYu, Zhimulev IF, Belyaeva ES. Late replication domains are evolutionary conserved in the Drosophila genome. PLoS ONE 8(12): e83319, 2013 • Zhimulev IF, Belyaeva ES, Vatolina TYu, Demakov SA. Banding patterns in Drosophila melanogaster polytene chromosomes correlate with DNA-binding protein occupancy. BioEssays 34: 498-508, 2012 • Vatolina TYu, Boldyreva LV, Demakova OV, Demakov SA, Kokoza EB, Semeshin VF, Babenko VN, Goncharov FP, Belyaeva ES, Zhimulev IF. Identical functional organization of cell line interphase and polytene chromosomes in Drosophila melanogaster. PLoS ONE 6(10): e25960, 2011 • Demakov SA, Vatolina TYu, Babenko VN, Semeshin VF, Belyaeva ES, Zhimulev IF. Protein composition of interband regions in polytene and cell line chromosomes of Drosophila melanogaster. BMC Genomics 12: 566, 2011 • Belyakin SN, Babenko VN, Maksimov DA, Shloma VV, Kvon EZ, Belyaeva ES, Zhimulev IF. Gene density profile reveals the marking of late replicated domains in the Drosophila melanogaster genome. Chromosoma 119: 589-600, 2010 • The modENCODE Consortium, Roy S., Ernst J., Kharchenko P.V., Kheradpour P., Ne`gre N., Eaton M.L., Landolin J.M., Bristow C.A., Ma L., Lin M.F., Washietl S., Arshinoff B.I., Ay F., Meyer P.E., Robine N., Washington N.L., Di Stefano L., Berezikov E., Brown C.D., Candeias R., Carlson J.W., Carr A., Jungreis I., Marbach D., Sealfon R., Tolstorukov M.Y., Will S., Alekseyenko A.A., Artieri C.G., Boley N., Booth B., Brooks A.N., Dai Q., Davis C.A., Duff M.O., Feng X., Gorchakov A.A., Gu G., Henikoff J.G., Kapranov P., Li R., MacAlpine H.K., Malone J.H., Minoda A., Nordman J.T., Okamura K, Perry M.D., PowellS.K., Riddle N.C., Sakai A., Samsonova A.A., Sandler J.E., Schwartz Y.B., Sher N., Spokony R., Sturgill D., van Baren M.J., Wan K.H., Yang L., Yu C., Feingold E.A., Good P.J., Guyer M.S., Lowdon R.F., Ahmad K., Andrews J., Berger B.A., Brenner S.E., Brent M.R., Cherbas L., Elgin S.C.R., Gingeras T.R., Grossman R.L., Hoskins R.A., Kaufman T.C., Kent W.J., Kuroda M.I., Orr-Weaver T.L., Perrimon N., Pirrotta V., Posakony J.W., Ren B., Russell S., Cherbas P., Graveley B.R., Lewis S., Micklem G., Oliver B., Park P.J., Celniker S.E., Henikoff S., Karpen G.H., Lai E.C., MacAlpine D.M., Stein L.D., White K.P., Kellis MIdentification of functional elements and regulatory circuits in Drosophila by large-scale data integration. Science. V. 330(6012). P. 1787-1797, 2010. • Babenko VN, Makunin IV, Brousentsova IV, Belyaeva ES, Maksimov DA, Belyakin SN, Maroy P, Vasil’eva LA, Zhimulev IF. Paucity and preferential suppression of transgenes in late replication domains of the D. melanogaster genome. BMC Genomics 11: 318, 2010 • Zhimulev IF, Koryakov DE. Polytene chromosomes. In: Encyclopedia of Life Sciences (ELS), John Wiley & Sons, Ltd: Chichester, 2009 • Yurlova AA, Makunin IV, Kolesnikova TD, Posukh OV, Belyaeva ES, Zhimulev IF. Conservation of domain structure in a fast-evolving heterochromatic SUUR protein in drosophilids. Genetics 183: 119-129, 2009 • Andreyenkova NG, Kokoza EB, Semeshin VF, Belyaeva ES, Demakov SA, Pindyurin AV, Andreyeva EN, Volkova EI, Zhimulev IF. Localization and characteristics of DNA underreplication zone in the 75C region of intercalary heterochromatin in Drosophila melanogaster polytene chromosomes. Chromosoma 118: 747-761, 2009 • Pindyurin AV, Boldyreva LV, Shloma VV, Kolesnikova TD, Pokholkova GV, Andreyeva EN, Kozhevnikova EN, Ivanoschuk IG, Zarutskaya EA, Demakov SA, Gorchakov AA, Belyaeva ES, Zhimulev IF. Interaction between the Drosophila heterochromatin proteins SUUR and HP1. J Cell Sci 121: 1693-1703, 2008 • Demakova OV, Pokholkova GV, Kolesnikova TD, Demakov SA, Andreyeva EN, Belyaeva ES, Zhimulev IF. The SU(VAR)3-9/HP1 complex differentially regulates the compaction state and degree of underreplication of X chromosome pericentric heterochromatin in Drosophila melanogaster. Genetics 175: 609-620, 2007 • Pindyurin AV, Moorman C, de Wit E, Belyakin SN, Belyaeva ES, Christophides GK, Kafatos FC, van Steensel B, Zhimulev IF. SUUR joins separate subsets of PcG, HP1 and B-type lamin targets in Drosophila. J Cell Sci 120, 2344-2351, 2007 • Andreyeva EN, Kolesnikova TD, Demakova OV, Mendez-Lago M, Pokholkova GV, Belyaeva ES, Rossi F, Corradini N, Dimitri P, Villasante A, Zhimulev IF. High-resolution analysis of Drosophila heterochromatin organization using SuUR Su(var)3-9 double mutants. Proc Natl Acad Sci USA 104: 12819-12824, 2007 • Koryakov DE, Reuter G, Dimitri P, Zhimulev IF. The SuUR gene influences the distribution of heterochromatic proteins HP1 and SU(VAR)3-9 on nurse cell polytene chromosomes of Drosophila melanogaster. Chromosoma 115: 296-310, 2006 • Salvaing J, Decoville M, Mouchel-Vielh E, Bussiere M, Daulny A, Boldyreva L, Zhimulev I, Locker D, Peronnet F. Corto and DSP1 interact and bind to a maintenance element of the Scr Hoxgene: understanding the role of Enhancers of trithorax and Polycomb. BMC Biology 4: 9, 2006 • Belyaeva ES, Demakov SA, Pokholkova GV, Alekseyenko AA, Kolesnikova TD, Zhimulev IF. DNA underreplication in intercalary heterochromatin regions in polytene chromosomes of Drosophila melanogaster correlates with the formation of partial chromosomal aberrations and ectopic pairing. Chromosoma 115: 355-366, 2006 • Belyakin SN, Christophides GK, Alekseyenko AA, Nanayev RA, Boldyreva LV, Belyaeva ES, Makunin IV, Heidelberg Fly Array Consortium, Kafatos FC, Zhimulev IF. Genomic analysis of Drosophila chromosome underreplication reveals a link between replication control and transcriptional territories. Proc Natl Acad Sci USA 102: 8269-8274, 2005 • Gortchakov AA, Eggert H, Gan M, Mattow J, Zhimulev IF, Saumweber H. Chriz, a chromodomain protein specific for the interbands of Drosophila melanogaster polytene chromosomes. Chromosoma 114: 54-66, 2005 • Zhimulev IF, Belyaeva ES, Semeshin VF, Koryakov DE, Demakov SA, Demakova OV, Pokholkova GV, Andreyeva EN. Polytene chromosomes: 70 years in genetic research. Int Rev Cytol 241: 203-275, 2004 • Degtyarev S, Boykova T, Grishanin A, Belyakin S, Rubtsov N, Karamysheva T, Makarevich G, Akifyev A, Zhimulev I. The molecular structure of the DNA fragments eliminated during chromatin diminution in Cyclops kolensis. Genome Res 14: 2284-2294, 2004 • Zhimulev IF, Belyaeva ES, Semeshin VF, Shloma VV, Makunin IV, Volkova EI. Overexpression of Drosophila melanogaster SuUR gene results in reversible chromatin reorganization at polytene chromosome pericentric, telomeric and intercalary heterochromatin. J Cell Sci 116: 169-176, 2003 • Koryakov DE, Domanitskaya EV, Belyakin SN, Zhimulev IF. Abnormal tissue-dependent polytenization of a block of chromosome 3 pericentric heterochromatin in Drosophila melanogaster. J Cell Sci 116: 1035-1044, 2003 • Cherbas LF, Hu X, Zhimulev I, Belyaeva E, Cherbas P. EcR isoforms in Drosophila: Testing tissue-specific requirements by targeted blockade and rescue. Development 130: 271-284, 2003 • Zhimulev IF, Belyaeva ES, Makunin IV, Pirrotta V, Volkova EI, Alekseyenko AA, Andreyeva EN, Makarevich GF, Boldyreva LV, Nanayev RA, Demakova OV. Influence of the SuUR gene on intercalary heterochromatin in Drosophila melanogaster polytene chromosomes. Chromosoma 111: 377-398, 2003 • Zhimulev IF, Belyaeva ES. Intercalary heterochromatin and genetic silencing. BioEssays 25: 1040-1050, 2003 • Demakova OV, Kotlikova IV, Gordadze PR, Alekseenko AA, Kelley RL, Kuroda MI, Zhimulev IF. The MSL complex levels are critical for its correct targeting to the chromosomes in Drosophila melanogaster. Chromosoma 112: 103-115, 2003 • Belyaeva ES, Boldyreva LV, Volkova EI, Nanayev RA, Alekseyenko AA, Zhimulev IF. Effect of the Suppressor of Underreplication gene (SuUR) on PEV-silencing in Drosophila melanogaster. Genetics 165: 1209-1220, 2003 • Holt RA,… Kokoza EB, Zhimulev IF,… Kafatos FC. The genome sequence of the malaria mosquito Anopheles gambiae. Science 298: 129-149, 2002 • Koryakov DE, Zhimulev IF, Dimitri P. Cytogenetics analysis of the third chromosome heterochromatin of Drospohila melanogaster. Genetics 160: 509-517, 2002 • Makunin IV, Volkova EI, Belyaeva ES, Nabirochkina EN, Pirrotta V, Zhimulev IF. The Drosophila Suppressor of Underreplicationprotein binds to late-replicating regions of polytene chromosomes. Genetics 160: 1023-1034, 2002 • Moshkin YM, Alekseyenko AA, Semeshin VF, Spierer A, Spierer P, Makarevich GF, Belyaeva ES, Zhimulev IF. The Bithorax Complex of Drosophila melanogaster. Underreplication and morphology in polytene chromosomes. Proc Natl Acad Sci USA 98: 570-574, 2001 • Belyaeva ES, Zhimulev IF, Volkova EI, Alekseyenko AA, Moshkin YM, Koryakov DE. Su(UR)ES a gene suppressing DNA underreplication in intercalary and pericentric heterochromatin of Drosophila melanogaster polytene chromosomes. Proc Natl Acad Sci USA 95: 7532-7537, 1998

• Профиль академика И. Ф. Жимулёва на официальном сайте РАН