Холмс, Кеннет Чарльз
| Кеннет Чарльз Холмс | |
|---|---|
| Kenneth Charles Holmes | |
| Дата рождения | 19 ноября 1934 |
| Место рождения | Хаммерсмит, Лондон |
| Дата смерти | 2 ноября 2021 (86 лет) |
| Страна | Великобритания |
| Род деятельности | биолог |
| Научная сфера | молекулярная биология |
| Место работы | |
| Альма-матер | |
| Научный руководитель | Розалинд Франклин, Аарон Клуг |
| Награды и премии | |
Кеннет Чарльз Холмс (англ. Kenneth Charles Holmes; 19 ноября 1934 — 2 ноября 2021) — британский кристаллограф, молекулярный биолог. Первым использовал синхротронное рентгеновское излучение для изучения структуры и динамики биологических объектов.
Биография
Кеннет Чарльз Холмс родился в Лондоне 19 ноября 1934 года в семье Сидни и Мэрион Холмс. Отец Кена Сидни Холмс работал учителем химии.
В 1942 году Кеннет поступил в начальную школу в Чизике. Школьный учитель математики обратил внимание на талантливого ребёнка и посоветовал Кену поступать в Кембриджский университет. Мальчик окончил школу экстерном и в 16 лет поступил в колледж Святого Иоанна в Кембридже. В университете он активно изучал естественные науки, специализируясь на кристаллографии.
Научную карьеру Холмс начал в колледже Биркбек в Лондоне в качестве научного ассистента в конце 1950-х годов под руководством Розалинд Франклин.
В 1960 году, получив постдокторскую стипендию в Фонде исследований детского рака при Бостонской детской больнице, он переехал в Бостон.
В 1968 году принял предложение возглавить новый отдел биофизики в Институте медицинских исследований имени Макса Планка в Гейдельберге.
В 1981 году был избран членом Лондонского королевского общества.
Холмс возглавлял Институт медицинских исследований Макса Планка вплоть до своего выхода на пенсию в 2003 году. После выхода на пенсию стал «почётным научным членом» Института.
В 2021 году получил премию EMBL.
Кеннет Чарльз Холмс сыграл очень важную роль в создании Европейской лаборатории молекулярной биологии (EMBL) в Гейдельберге. Его серьёзные успехи в использовании синхротронного излучения и планы по созданию синхротронной станции на накопительном кольце DORIS внесли существенный вклад при принятии решения о размещении EMBL в Гейдельберге.
Как руководитель Кеннет Холмс отличался демократичностью и поддерживал инициативы молодых учёных. Его ученики могли свободно развиваться в интересующих их направлениях, что в итоге привело к созданию независимых научно-исследовательских групп[3]. Например, в его отделе проводились новаторские исследования GTPаз и онкобелка Ras, которые возглавлял Альфред Виттингхофер[4][5].
Научная карьера
Работа с Розалинд Франклин и изучение вируса табачной мозаики
В колледже Биркбек в Лондоне под руководством Розалинд Франклин Кеннет Холмс изучал структуру вируса табачной мозаики. Он проанализировал радиальное распределение плотности вируса и установил, что вирусная частица имеет полый центр, и что РНК встроена между белковыми субъединицами. В ходе этой работы Холмс одним из первых применил компьютерные вычисления для обработки дифракционных данных, используя ранние ЭВМ для расчета функций Бесселя[6]. После преждевременной смерти Франклин в 1958 году его научным руководителем стал Аарон Клуг[7].
Работа в Бостоне и возвращение в Кембридж
В 1960 году Холмс начал сотрудничество с Доном Каспаром и Кэролайн Коэн. Значительным достижением этого периода стало экспериментальное доказательство выдвинутой ранее Фрэнсисом Криком гипотезы о структуре спиральной катушки («coiled-coil»). Для доказательства гипотезы Холмс и Коэн использовали мышцу моллюска Mytilus edulis. Они установили, что дифракционная картина, которую дает парамиозин, в точности соответствует теоретическим предсказаниям для двухцепочечной спиральной катушки[8].
Летом 1961 года Холмс вернулся в Кембридж, чтобы продолжить исследование вируса табачной мозаики в научной группе Аарона Клуга. Основной проблемой генераторов рентгеновского излучения этого времени были недостаточная точность фокусировки и относительно невысокая интенсивность рентгеновского излучения, поэтому совместно с Биллом Лонгли и Тони Вулардом был разработан высокофокусный рентгеновский генератор с вращающимся анодом (позже известный как Elliott GX-6)[7]. Благодаря этой разработке будут определены многие важные структуры. Но для исследования мышечной динамики нужна была интенсивность излучения минимум в тысячу раз превышающая ту, которую давал такой генератор. Это послужило поводом для Холмса задуматься об использовании синхротронного излучения. Совместно с Джулианом Швингером они провели теоретический расчёт интенсивности такого излучения и заключили, что её будет достаточно для их нужд, однако подходящие синхротронные кольца в этот момент находились на стадии разработки, поэтому идею пришлось отложить на пять лет[9].
Переезд в Гейдельберг и революция синхротронного излучения
Переезд в Гейдельберг позволил Холмсу вернуться к идее об использовании синхротронного излучения для исследования мышечной динамики. Научная группа под его руководством разработала изогнутый кварцевый монохроматор для фокусировки и монохромизации рентгеновского излучения. В августе 1970 года впервые была получена дифракционная картина на полоске мышечной ткани насекомого с помощью синхротронного излучения, тем самым доказав, что синхротронное излучение может служить высокочастотным источником рентгеновских лучей для исследования биологических объектов. Из-за высокой коллимации рентгеновского пучка синхротронного излучения удалось получить более качественные дифракционные картины белковых кристаллов, в которых соотношение сигнал/шум было во много раз больше, чем при коллимации от обычного рентгеновского излучения[10]. Это открытие оказало сильное влияние на всю область структурной биологии.
Исследование мышечного сокращения
Холмс хотел установить молекулярный механизм сокращения мышц. Он доказал механизм «качающегося поперечного мостика», предложенного Хью Хаксли, и показал отличия в структурах ригидной и расслабленной мышц.
В 1990 году, используя кристаллографические данные комплекса актина с ДНКазой I, Холмс предложил первую атомную модель актинового филамента (F-актина). Объединив эту модель с кристаллической структурой миозина и данными криоэлектронной микроскопии, он предложил модель актомиозинового комплекса. Таким образом, он переформулировал теорию мышечного сокращения в гипотезу «качающегося рычага» (swinging lever arm), согласно которой основная часть головки миозина остается фиксированной на актине, а движение и генерация силы происходят за счет поворота дистального домена молекулы[11].
Личная жизнь
Кеннет Холмс был женат на Мэри Скруби, с которой познакомился на праздничной вечеринке для сотрудников Биркбекского колледжа. Они поженились в 1957 году. У них было четверо детей: Элизабет, Эндрю, Ребекка и Анна.
На протяжении всей жизни Холмс увлекался музыкой (пел баритоном в хорах) и академической греблей. Он продолжал участвовать в соревнованиях ветеранов до преклонного возраста, выиграв множество международных регат в составе двойки[3].
Примечания
- ↑ 1 2 3 https://orcid.org/0000-0001-8894-9453
- ↑ Montenegro A. ORCID Public Data File 2023 — 2023. — doi:10.23640/07243.24204912.V1
- ↑ 1 2 Stephen C. Harrison ForMemsRS. Kenneth Charles Holmes. 19 November 1934—2 November 2021 // Biographical Memoirs of Fellows of the Royal Society. — 2025-05-22. — Т. 78. — С. 187–208. — ISSN 1748-8494. — doi:10.1098/rsbm.2024.0035.
- ↑ Emil F. Pai, Wolfgang Kabsch, Ute Krengel, Kenneth C. Holmes, Jacob John, Alfred Wittinghofer. Structure of the guanine-nucleotide-binding domain of the Ha-ras oncogene product p21 in the triphosphate conformation // Nature. — 1989-09. — Т. 341, вып. 6239. — С. 209–214. — ISSN 0028-0836. — doi:10.1038/341209a0.
- ↑ Anna Scherer, Jacob John, Rosita Linke, Roger S. Goody, Alfred Wittinghofer, Emll F. Pai, Kenneth C. Holmes. Crystallization and preliminary X-ray analysis of the human c-H-ras-oncogene product p21 complexed with GTP analogues // Journal of Molecular Biology. — 1989-03. — Т. 206, вып. 1. — С. 257–259. — ISSN 0022-2836. — doi:10.1016/0022-2836(89)90540-8.
- ↑ R. E. Franklin, K. C. Holmes. Tobacco mosaic virus: application of the method of isomorphous replacement to the determination of the helical parameters and radial density distribution // Acta Crystallographica. — 1958-03-10. — Т. 11, вып. 3. — С. 213–220. — ISSN 0365-110X. — doi:10.1107/s0365110x58000529.
- ↑ 1 2 Holmes K.C. 50 years of fiber diffraction // J. Struct. Biol., 2010, v. 170, p. 184—191.
- ↑ Carolyn Cohen, Kenneth C. Holmes. X-ray diffraction evidence for α-helical coiled-coils in native muscle // Journal of Molecular Biology. — 1963-05. — Т. 6, вып. 5. — С. 423–IN11. — ISSN 0022-2836. — doi:10.1016/s0022-2836(63)80053-4.
- ↑ Caspar D.L.D., Holmes K.C. Structure of dahlemense strain of tobacco mosaic virus: a periodically deformed helix // J. Mol. Biol., 1969, v. 46, p. 101—133.
- ↑ G. ROSENBAUM, K. C. HOLMES, J. WITZ. Synchrotron Radiation as a Source for X-ray Diffraction // Nature. — 1971-04. — Т. 230, вып. 5294. — С. 434–437. — ISSN 0028-0836. — doi:10.1038/230434a0.
- ↑ Kenneth C Holmes. The swinging lever-arm hypothesis of muscle contraction // Current Biology. — 1997-02. — Т. 7, вып. 2. — С. R112–R118. — ISSN 0960-9822. — doi:10.1016/s0960-9822(06)00051-0.