Ku80

X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 5 (double-strand-break rejoining)
PDB rendering based on 1jeq.
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Идентификаторы
Символ XRCC5 ; KARP-1; KARP1; KU80; KUB2; Ku86; NFIV
Внешние ID OMIM: 194364 MGI: 104517 HomoloGene: 40681 GeneCards: Ген XRCC5
номер EC 3.6.1. EC 3.6.1.
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
Вид Человек Мышь
Entrez 7520 22596
Ensembl ENSG00000079246 ENSMUSG00000026187
UniProt P13010 P27641
RefSeq (мРНК) NM_021141 NM_009533
RefSeq (белок) NP_066964 NP_033559
Локус (UCSC) Chr 2:
216.11 – 216.21 Mb
Chr 1:
72.31 – 72.39 Mb
Поиск в PubMed Искать Искать

Ku80 — белок, закодированный у человека геном XRCC5.[1] Вместе с белком Ku70 белок Ku80 образует гетеродимер, связывающийся с концами двунитевых разрывов в ДНК, и требуется для репарации ДНК путём негомологичного соединения концов (NHEJ). Также белок Ku требуется для V(D)J рекомбинации, которая использует путь NHEJ для создания разнообразия антиген-связывающих центров антител в иммунной системе млекопитающих.

Также Ku требуется для поддержания длины теломер и сайленсинга прителомерных генов.[2]

Ku был впервые обнаружен у пациентов с системной красной волчанкой, у которых были выявлены высокие титры антител против этого белка.[1]

Ku80 имеет несколько других названий:

  • Ku аутоантиген, белок p80 волчанки
  • субъединица 2 АТР-зависимой ДНК-хеликазы 2
  • XRCC5 (англ. X-ray repair cross-complementing 5)

Клиническое значение

Редкий микросателлитный полиморфизм данного гена связан с опухолями у пациентов с различной чувствительностью к радиоактивности.[3]

Взаимодействия

Показаны белок-белковые взаимодействия Ku80 с NCOA6,[4][5] GCN5L2,[6] Ku70,[6][7][8][9][10] АТР-зависимой хеликазой синдрома Вернера,[11][12] Тирозин-киназой 2,[13] белком c-Abl в гомологичном киназе каталитическом участке ДНК-зависимой протеинкиназы,[14][15][7] TERF2IP,[16] обратной транскриптазой теломер,[17] POU2F1[18][15] и белком PCNA.[15][19][20]

Примечания

  1. 1 2 Entrez Gene: XRCC6 X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 6 (Ku autoantigen, 70kDa).
  2. Boulton S.J., Jackson S.P. Components of the Ku-dependent non-homologous end-joining pathway are involved in telomeric length maintenance and telomeric silencing (англ.) // EMBO J. : journal. — 1998. — March (vol. 17, no. 6). — P. 1819—1828. — doi:10.1093/emboj/17.6.1819. — PMID 9501103. — PMC 1170529.
  3. Entrez Gene: XRCC5 X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 5 (double-strand-break rejoining; Ku autoantigen, 80kDa). Архивировано 8 марта 2010 года.
  4. Ko, L; Cardona G R., Chin W W. Thyroid hormone receptor-binding protein, an LXXLL motif-containing protein, functions as a general coactivator (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — UNITED STATES, 2000. — May (vol. 97, no. 11). — P. 6212—6217. — ISSN 0027-8424. — PMID 10823961.
  5. Ko, Lan; Chin William W. Nuclear receptor coactivator thyroid hormone receptor-binding protein (TRBP) interacts with and stimulates its associated DNA-dependent protein kinase (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — United States, 2003. — March (vol. 278, no. 13). — P. 11471—11479. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.M209723200. — PMID 12519782.
  6. 1 2 Barlev, N A; Poltoratsky V., Owen-Hughes T., Ying C., Liu L., Workman J L., Berger S L. Repression of GCN5 histone acetyltransferase activity via bromodomain-mediated binding and phosphorylation by the Ku-DNA-dependent protein kinase complex (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — UNITED STATES, 1998. — March (vol. 18, no. 3). — P. 1349—1358. — ISSN 0270-7306. — PMID 9488450.
  7. 1 2 Gell, D; Jackson S P. Mapping of protein-protein interactions within the DNA-dependent protein kinase complex (англ.) // Nucleic Acids Res. : journal. — ENGLAND, 1999. — September (vol. 27, no. 17). — P. 3494—3502. — PMID 10446239.
  8. Yang, C R; Yeh S., Leskov K., Odegaard E., Hsu H L., Chang C., Kinsella T J., Chen D J., Boothman D A. Isolation of Ku70-binding proteins (KUBs) (англ.) // Nucleic Acids Res. : journal. — ENGLAND, 1999. — May (vol. 27, no. 10). — P. 2165—2174. — ISSN 0305-1048. — PMID 10219089.
  9. Singleton, B K; Torres-Arzayus M I., Rottinghaus S T., Taccioli G E., Jeggo P A. The C terminus of Ku80 activates the DNA-dependent protein kinase catalytic subunit (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — UNITED STATES, 1999. — May (vol. 19, no. 5). — P. 3267—3277. — ISSN 0270-7306. — PMID 10207052.
  10. Song, K; Jung D., Jung Y., Lee S G., Lee I. Interaction of human Ku70 with TRF2 (англ.) // FEBS Lett. : journal. — NETHERLANDS, 2000. — September (vol. 481, no. 1). — P. 81—5. — ISSN 0014-5793. — PMID 10984620.
  11. Karmakar, Parimal; Snowden Carey M., Ramsden Dale A., Bohr Vilhelm A. Ku heterodimer binds to both ends of the Werner protein and functional interaction occurs at the Werner N-terminus (англ.) // Nucleic Acids Res. : journal. — England, 2002. — August (vol. 30, no. 16). — P. 3583—3591. — PMID 12177300.
  12. Li, B; Comai L. Functional interaction between Ku and the werner syndrome protein in DNA end processing (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — UNITED STATES, 2000. — September (vol. 275, no. 37). — P. 28349—28352. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.C000289200. — PMID 10880505.
  13. Adam, L; Bandyopadhyay D., Kumar R. Interferon-alpha signaling promotes nucleus-to-cytoplasmic redistribution of p95Vav, and formation of a multisubunit complex involving Vav, Ku80, and Tyk2 (англ.) // Biochem. Biophys. Res. Commun. : journal. — UNITED STATES, 2000. — January (vol. 267, no. 3). — P. 692—696. — ISSN 0006-291X. — doi:10.1006/bbrc.1999.1978. — PMID 10673353.
  14. Jin, S; Kharbanda S., Mayer B., Kufe D., Weaver D T. Binding of Ku and c-Abl at the kinase homology region of DNA-dependent protein kinase catalytic subunit (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — UNITED STATES, 1997. — October (vol. 272, no. 40). — P. 24763—24766. — ISSN 0021-9258. — PMID 9312071.
  15. 1 2 3 Matheos, Diamanto; Ruiz Marcia T., Price Gerald B., Zannis-Hadjopoulos Maria. Ku antigen, an origin-specific binding protein that associates with replication proteins, is required for mammalian DNA replication (англ.) // Biochim. Biophys. Acta : journal. — Netherlands, 2002. — October (vol. 1578, no. 1—3). — P. 59—72. — ISSN 0006-3002. — PMID 12393188.
  16. O'Connor, Matthew S; Safari Amin, Liu Dan, Qin Jun, Songyang Zhou. The human Rap1 protein complex and modulation of telomere length (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — United States, 2004. — July (vol. 279, no. 27). — P. 28585—28591. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.M312913200. — PMID 15100233.
  17. Chai, Weihang; Ford Lance P., Lenertz Lisa, Wright Woodring E., Shay Jerry W. Human Ku70/80 associates physically with telomerase through interaction with hTERT (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — United States, 2002. — December (vol. 277, no. 49). — P. 47242—47247. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.M208542200. — PMID 12377759.
  18. Schild-Poulter, C; Pope L., Giffin W., Kochan J C., Ngsee J K., Traykova-Andonova M., Haché R J. The binding of Ku antigen to homeodomain proteins promotes their phosphorylation by DNA-dependent protein kinase (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — United States, 2001. — May (vol. 276, no. 20). — P. 16848—16856. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.M100768200. — PMID 11279128.
  19. Ohta, Satoshi; Shiomi Yasushi, Sugimoto Katsunori, Obuse Chikashi, Tsurimoto Toshiki. A proteomics approach to identify proliferating cell nuclear antigen (PCNA)-binding proteins in human cell lysates. Identification of the human CHL12/RFCs2-5 complex as a novel PCNA-binding protein (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — United States, 2002. — October (vol. 277, no. 43). — P. 40362—40367. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.M206194200. — PMID 12171929.
  20. Balajee, A S; Geard C R. Chromatin-bound PCNA complex formation triggered by DNA damage occurs independent of the ATM gene product in human cells (англ.) // Nucleic Acids Res. : journal. — England, 2001. — March (vol. 29, no. 6). — P. 1341—1351. — PMID 11239001.

Литература