POLR2C

Полипептид C РНК-полимеразы II (управляемой ДНК)
Полипептид C РНК-полимеразы II (управляемой ДНК)
Идентификаторы
Символ	POLR2C ; RPB3; RPB31; hRPB33; hsRPB3
Внешние ID	OMIM: 180663 MGI: 109299 HomoloGene: 2017 GeneCards: Ген POLR2C
номер EC	2.7.7.6
Функция	• RNA polymerase II activity; • DNA binding; • protein dimerization activity;
Компонент клетки	• nucleus; • nucleoplasm; • DNA-directed RNA polymerase II, core complex; • nucleolus; • cytoplasm; • microtubule cytoskeleton;
Биологический процесс	• mRNA splicing, via spliceosome; • DNA repair; • transcription-coupled nucleotide-excision repair; • nucleotide-excision repair; • transcription from RNA polymerase II promoter; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • transcription elongation from RNA polymerase II promoter; • 7-methylguanosine mRNA capping; • RNA splicing; • gene expression; • viral process; • positive regulation of viral transcription;
	Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
	Больше информации
Ортологи

Субъединица RPB3 ДНК-управляемой РНК-полимеразы II — фермент, кодируемый у человека геном POLR2C .^[1]

Функция

Этот ген кодирует третью по величине субъединицу РНК-полимеразы II, полимеразы, ответственной за синтез мессенджера РНК у эукариот. Продукт этого гена содержит богатую цистеином область и существует в виде гетеродимера с другой полимеразной субъединицей, POLR2J. Эти две субъединицы образуют основной блок полимеразы. Псевдоген был идентифицирован на хромосоме 21.^[2]

Взаимодействия

POLR2C, как было выявлено, взаимодействуют с:

ATF4,^[3]
CCHCR1,^[4]
Myogenin,^[5]
POLR2A,^[6]
POLR2B,^[6]
POLR2E^[6]
POLR2F,^[6]
POLR2G,^[6]
POLR2H,^[6]
POLR2J,^[6]^[5]
POLR2K,^[6]
POLR2L,^[6]
TAF15.^[7]

Примечания

↑ Acker J., Mattei M.G., Wintzerith M., Roeckel N., Depetris D., Vigneron M., Kedinger C. Chromosomal localization of human RNA polymerase II subunit genes (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 1994. — August (vol. 20, no. 3). — P. 496—499. — doi:10.1006/geno.1994.1208. — PMID 8034326.
↑ Entrez Gene: POLR2C polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide C, 33kDa .
↑ De Angelis R., Iezzi S., Bruno T., Corbi N., Di Padova M., Floridi A., Fanciulli M., Passananti C. Functional interaction of the subunit 3 of RNA polymerase II (RPB3) with transcription factor-4 (ATF4) (англ.) // FEBS Lett. : journal. — 2003. — July (vol. 547, no. 1—3). — P. 15—9. — doi:10.1016/s0014-5793(03)00659-8. — PMID 12860379.
↑ Corbi N., Bruno T., De Angelis R., Di Padova M., Libri V., Di Certo M.G., Spinardi L., Floridi A., Fanciulli M., Passananti C. RNA polymerase II subunit 3 is retained in the cytoplasm by its interaction with HCR, the psoriasis vulgaris candidate gene product (англ.) // Journal of Cell Science : journal. — The Company of Biologists, 2005. — September (vol. 118, no. Pt 18). — P. 4253—4260. — doi:10.1242/jcs.02545. — PMID 16141233.
↑ ¹ ² Corbi N., Di Padova M., De Angelis R., Bruno T., Libri V., Iezzi S., Floridi A., Fanciulli M., Passananti C. The alpha-like RNA polymerase II core subunit 3 (RPB3) is involved in tissue-specific transcription and muscle differentiation via interaction with the myogenic factor myogenin (англ.) // The FASEB Journal : journal. — Federation of American Societies for Experimental Biology, 2002. — October (vol. 16, no. 12). — P. 1639—1641. — doi:10.1096/fj.02-0123fje. — PMID 12207009.
↑ ¹ ² ³ ⁴ ⁵ ⁶ ⁷ ⁸ ⁹ Acker J., de Graaff M., Cheynel I., Khazak V., Kedinger C., Vigneron M. Interactions between the human RNA polymerase II subunits (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1997. — July (vol. 272, no. 27). — P. 16815—16821. — doi:10.1074/jbc.272.27.16815. — PMID 9201987.
↑ Bertolotti A., Melot T., Acker J., Vigneron M., Delattre O., Tora L. EWS, but not EWS-FLI-1, is associated with both TFIID and RNA polymerase II: interactions between two members of the TET family, EWS and hTAFII68, and subunits of TFIID and RNA polymerase II complexes (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 1998. — March (vol. 18, no. 3). — P. 1489—1497. — PMID 9488465. — PMC 108863.

Литература

Jeang K.T. Tat, Tat-associated kinase, and transcription. (англ.) // J. Biomed. Sci. : journal. — 1998. — Vol. 5, no. 1. — P. 24—7. — doi:10.1007/BF02253352. — PMID 9570510.
Yankulov K., Bentley D. Transcriptional control: Tat cofactors and transcriptional elongation. (англ.) // Curr. Biol. : journal. — 1998. — Vol. 8, no. 13. — P. R447—9. — doi:10.1016/S0960-9822(98)70289-1. — PMID 9651670.
Romano G., Kasten M., De Falco G., Micheli P., Khalili K., Giordano A. Regulatory functions of Cdk9 and of cyclin T1 in HIV tat transactivation pathway gene expression. (англ.) // J. Cell. Biochem. : journal. — 2000. — Vol. 75, no. 3. — P. 357—368. — doi:10.1002/(SICI)1097-4644(19991201)75:3<357::AID-JCB1>3.0.CO;2-K. — PMID 10536359.
Marcello A., Zoppé M., Giacca M. Multiple modes of transcriptional regulation by the HIV-1 Tat transactivator. (англ.) // IUBMB Life : journal. — 2002. — Vol. 51, no. 3. — P. 175—181. — doi:10.1080/152165401753544241. — PMID 11547919.
Stevens M., De Clercq E., Balzarini J. The regulation of HIV-1 transcription: molecular targets for chemotherapeutic intervention. (англ.) // Med Res Rev : journal. — 2007. — Vol. 26, no. 5. — P. 595—625. — doi:10.1002/med.20081. — PMID 16838299.
Harrich D., McMillan N., Munoz L., Apolloni A., Meredith L. Will diverse Tat interactions lead to novel antiretroviral drug targets? (англ.) // Current drug targets : journal. — 2007. — Vol. 7, no. 12. — P. 1595—1606. — doi:10.2174/138945006779025338. — PMID 17168834.
Kato H., Sumimoto H., Pognonec P., Chen C.H., Rosen C.A., Roeder R.G. HIV-1 Tat acts as a processivity factor in vitro in conjunction with cellular elongation factors. (англ.) // Genes Dev. : journal. — 1992. — Vol. 6, no. 4. — P. 655—666. — doi:10.1101/gad.6.4.655. — PMID 1559613.
Pati U.K., Weissman S.M. The amino acid sequence of the human RNA polymerase II 33-kDa subunit hRPB 33 is highly conserved among eukaryotes. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1990. — Vol. 265, no. 15. — P. 8400—8403. — PMID 2187864.
Southgate C., Zapp M.L., Green M.R. Activation of transcription by HIV-1 Tat protein tethered to nascent RNA through another protein. (англ.) // Nature : journal. — 1990. — Vol. 345, no. 6276. — P. 640—642. — doi:10.1038/345640a0. — PMID 2190099.
Wu-Baer F., Sigman D., Gaynor R.B. Specific binding of RNA polymerase II to the human immunodeficiency virus trans-activating region RNA is regulated by cellular cofactors and Tat. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1995. — Vol. 92, no. 16. — P. 7153—7157. — doi:10.1073/pnas.92.16.7153. — PMID 7638159. — PMC 41297.
Herrmann C.H., Rice A.P. Lentivirus Tat proteins specifically associate with a cellular protein kinase, TAK, that hyperphosphorylates the carboxyl-terminal domain of the large subunit of RNA polymerase II: candidate for a Tat cofactor. (англ.) // J. Virol. : journal. — 1995. — Vol. 69, no. 3. — P. 1612—1620. — PMID 7853496. — PMC 188757.
Keen N.J., Gait M.J., Karn J. Human immunodeficiency virus type-1 Tat is an integral component of the activated transcription-elongation complex. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1996. — Vol. 93, no. 6. — P. 2505—2510. — doi:10.1073/pnas.93.6.2505. — PMID 8637904. — PMC 39827.
Yang X., Herrmann C.H., Rice A.P. The human immunodeficiency virus Tat proteins specifically associate with TAK in vivo and require the carboxyl-terminal domain of RNA polymerase II for function. (англ.) // J. Virol. : journal. — 1996. — Vol. 70, no. 7. — P. 4576—4584. — PMID 8676484. — PMC 190394.
Agostini I., Navarro J.M., Rey F., Bouhamdan M., Spire B., Vigne R., Sire J. The human immunodeficiency virus type 1 Vpr transactivator: cooperation with promoter-bound activator domains and binding to TFIIB. (англ.) // J. Mol. Biol. : journal. — 1996. — Vol. 261, no. 5. — P. 599—606. — doi:10.1006/jmbi.1996.0485. — PMID 8800208.
Zhou Q., Sharp P.A. Tat-SF1: cofactor for stimulation of transcriptional elongation by HIV-1 Tat. (англ.) // Science : journal. — 1996. — Vol. 274, no. 5287. — P. 605—610. — doi:10.1126/science.274.5287.605. — PMID 8849451.
Okamoto H., Sheline C.T., Corden J.L., Jones K.A., Peterlin B.M. Trans-activation by human immunodeficiency virus Tat protein requires the C-terminal domain of RNA polymerase II. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1996. — Vol. 93, no. 21. — P. 11575—11579. — doi:10.1073/pnas.93.21.11575. — PMID 8876177. — PMC 38099.
Chun R.F., Jeang K.T. Requirements for RNA polymerase II carboxyl-terminal domain for activated transcription of human retroviruses human T-cell lymphotropic virus I and HIV-1. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1996. — Vol. 271, no. 44. — P. 27888—27894. — doi:10.1074/jbc.271.44.27888. — PMID 8910388.
Parada C.A., Roeder R.G. Enhanced processivity of RNA polymerase II triggered by Tat-induced phosphorylation of its carboxy-terminal domain. (англ.) // Nature : journal. — 1996. — Vol. 384, no. 6607. — P. 375—378. — doi:10.1038/384375a0. — PMID 8934526.
García-Martínez L.F., Ivanov D., Gaynor R.B. Association of Tat with purified HIV-1 and HIV-2 transcription preinitiation complexes. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1997. — Vol. 272, no. 11. — P. 6951—6958. — doi:10.1074/jbc.272.11.6951. — PMID 9054383.

[pmid8034326-1] Acker J., Mattei M.G., Wintzerith M., Roeckel N., Depetris D., Vigneron M., Kedinger C. Chromosomal localization of human RNA polymerase II subunit genes (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 1994. — August (vol. 20, no. 3). — P. 496—499. — doi:10.1006/geno.1994.1208. — PMID 8034326.

[2] Entrez Gene: POLR2C polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide C, 33kDa .

[pmid12860379-3] De Angelis R., Iezzi S., Bruno T., Corbi N., Di Padova M., Floridi A., Fanciulli M., Passananti C. Functional interaction of the subunit 3 of RNA polymerase II (RPB3) with transcription factor-4 (ATF4) (англ.) // FEBS Lett. : journal. — 2003. — July (vol. 547, no. 1—3). — P. 15—9. — doi:10.1016/s0014-5793(03)00659-8. — PMID 12860379.

[pmid16141233-4] Corbi N., Bruno T., De Angelis R., Di Padova M., Libri V., Di Certo M.G., Spinardi L., Floridi A., Fanciulli M., Passananti C. RNA polymerase II subunit 3 is retained in the cytoplasm by its interaction with HCR, the psoriasis vulgaris candidate gene product (англ.) // Journal of Cell Science : journal. — The Company of Biologists, 2005. — September (vol. 118, no. Pt 18). — P. 4253—4260. — doi:10.1242/jcs.02545. — PMID 16141233.

[pmid12207009-5] ¹ ² Corbi N., Di Padova M., De Angelis R., Bruno T., Libri V., Iezzi S., Floridi A., Fanciulli M., Passananti C. The alpha-like RNA polymerase II core subunit 3 (RPB3) is involved in tissue-specific transcription and muscle differentiation via interaction with the myogenic factor myogenin (англ.) // The FASEB Journal : journal. — Federation of American Societies for Experimental Biology, 2002. — October (vol. 16, no. 12). — P. 1639—1641. — doi:10.1096/fj.02-0123fje. — PMID 12207009.

[pmid9201987-6] ¹ ² ³ ⁴ ⁵ ⁶ ⁷ ⁸ ⁹ Acker J., de Graaff M., Cheynel I., Khazak V., Kedinger C., Vigneron M. Interactions between the human RNA polymerase II subunits (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1997. — July (vol. 272, no. 27). — P. 16815—16821. — doi:10.1074/jbc.272.27.16815. — PMID 9201987.

[pmid9488465-7] Bertolotti A., Melot T., Acker J., Vigneron M., Delattre O., Tora L. EWS, but not EWS-FLI-1, is associated with both TFIID and RNA polymerase II: interactions between two members of the TET family, EWS and hTAFII68, and subunits of TFIID and RNA polymerase II complexes (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 1998. — March (vol. 18, no. 3). — P. 1489—1497. — PMID 9488465. — PMC 108863.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]