SHELX
| SHELX | |||
|---|---|---|---|
| Тип | Программное обеспечение для кристаллографии | ||
| Автор | Джордж М. Шелдрик | ||
| Разработчики | Джордж М. Шелдрик и др. сотрудники кафедры структурной химии Гёттингенского университета | ||
| Написана на | Fortran | ||
| Операционные системы | Microsoft Windows, Linux, macOS | ||
| Первый выпуск | 1970[1] | ||
| Последняя версия | 2025/1 | ||
| |||
| |||
| Лицензия | Бесплатное ПО для академического использования / Платное для коммерческого | ||
| Сайт | shelx.uni-goettingen.de | ||
SHELX — пакет программ, созданный Джорджем М. Шелдриком для определения и анализа кристаллических структур молекулярных соединений и макромолекул. Пакет обрабатывает данные, полученные методом дифракции монохроматического рентгеновского или нейтронного излучения на монокристаллах. В состав пакета входит несколько отдельных исполняемых программ, совместимых со всеми современными версиями Linux, Microsoft Windows и macOS. Использование программного обеспечения бесплатно для академических учреждений, в то время как коммерческие организации должны приобретать лицензию[3].
Значимость пакета подчёркивается тем, что одна из посвящённых ему статей занимает 5-е место в рейтинге самых цитируемых научных публикаций XXI века во всех областях науки[4].
Обзор
Отдельные программы пакета могут быть запущены из графических пользовательских интерфейсов, таких как shelXle, Olex2, Oscail или WinGX. Также возможен запуск программ из командной строки.
SHELX-2019 включает в себя следующие программы[5]:
- SHELXT — предназначена для решения молекулярных структур[6].
- SHELXS — содержит классические прямые методы для решения молекулярных структур.
- SHELXL — используется для уточнения молекулярных структур[7].
- PDB2INS — создаёт входные файлы для уточнения макромолекул с помощью SHELXL[8].
- CIFTAB и ShredCIF — позволяют редактировать и обрабатывать файлы формата CIF.
- SHELXC, SHELXD и SHELXE — обрабатывают структурные данные макромолекул[9].
- AnoDe — позволяет анализировать карты электронной плотности макромолекул.
Архитектура программы
Программы написаны на языке Fortran[10]. С 2000 года разрабатываются распараллеленные версии программ для многопроцессорных систем[11][12].
Литература
- Sheldrick, G. M. A short history of SHELX // Acta Cryst. A64 (2008) P. 112–122. doi:10.1107/S0108767307043930.
- Müller, P., Herbst-irmer, R., Spek, A. L., Schneider, T. R. Crystal Structure Refinement: A Crystallographer's Guide to SHELXL. — (International Union of Crystallography Texts on Crystallography, Band 19). — 2006. — ISBN 978-0-19-857076-9.
Примечания
- ↑ Sheldrick G. M. A short history of SHELX (англ.) // Acta Crystallographica Section A: Foundations and Advances — Wiley-Blackwell, 2007. — Vol. 64, Iss. 1. — P. 112. — ISSN 0108-7673; 1600-5724; 2053-2733 — doi:10.1107/S0108767307043930 — PMID:18156677
- ↑ http://shelx.uni-goettingen.de/cif.php
- ↑ The SHELX homepage (англ.). Дата обращения: 21 мая 2024.
- ↑ Exclusive: the most-cited papers of the twenty-first century: A Nature analysis reveals the 25 highest-cited papers published this century and explores why they are breaking records. (англ.). Дата обращения: 25 апреля 2025.
- ↑ SHELX wikis and manuals (англ.). Дата обращения: 21 мая 2024.
- ↑ George M. Sheldrick. SHELXT – Integrated space-group and crystal-structure determination (англ.) // Acta Crystallographica Section A Foundations and Advances. — 2015. — Vol. 71, no. 1. — P. 3–8. — doi:10.1107/S2053273314026370.
- ↑ George M. Sheldrick. Crystal structure refinement with SHELXL (англ.) // Acta Crystallographica Section C Structural Chemistry. — 2015. — Vol. 71, no. 1. — P. 3–8. — doi:10.1107/S2053229614024218.
- ↑ PDB2INS : bridging the gap between small-molecule and macromolecular refinement (англ.) // Journal of Applied Crystallography. — 2019. — Vol. 52, no. 3. — P. 669–673. — doi:10.1107/S1600576719005478.
- ↑ Extending molecular-replacement solutions with SHELXE (англ.) // Acta Crystallographica Section D Biological Crystallography. — 2013. — Vol. 69, no. 11. — P. 2251–2256. — doi:10.1107/S0907444913027534.
- ↑ G. M. Sheldrick. Some algorithms used in SHELX (англ.) (PDF). Дата обращения: 21 мая 2024.
- ↑ G. M. Sheldrick. Programs for multiple-CPU computers (англ.) (PDF). Дата обращения: 21 мая 2024.
- ↑ Kay Diederichs. Computing in macromolecular crystallography using a parallel architecture (англ.) // Journal of Applied Crystallography. — 2000. — Vol. 33, no. 4. — P. 1154–1161. — doi:10.1107/S002188980000697X.