| B3GAT1 |
|---|
|
|
|
| Псевдонимы | B3GAT1, CD57, GLCATP, GLCUATP, HNK1, LEU7, NK-1, NK1, beta-1,3-glucuronyltransferase 1 |
|---|
| Внешние ID | OMIM: 151290 MGI: 1924148 HomoloGene: 49551 GeneCards: B3GAT1 |
|---|
|
|
|
|
| Молекулярная функция | | | Компонент клетки | | | Биологический процесс | | | Источники: Amigo, QuickGO |
|
|
| Информация в Викиданных |
|
Галактозилгалактозилксилозилпротеин-3-бета-глюкуронозилтрансфераза типа 1 (англ. Galactosylgalactosylxylosylprotein 3-beta-glucuronosyltransferase 1; B3GAT1; CD57) — фермент из семейства глюкуронозилтрансфераз, продукт гена человека B3GAT1. Активность фермента образует эпитопы CD57 на поверхности других клеток[5]. В иммунологии антиген CD57 (HNK1, LEU7) — эпитоп, содержащий остатки углевода сульфоглюкуронила, связанные с несколькими белками адгезии нервной системы[6].
Функции
Белок гена B3GAT1 входит в семейство глюкуронозилтрансфераз. Ферменты этого семейства обладают высокой специфичностью по отношению к акцептору, они распознают невосстановляемые конечные группы сахаров и их аномерные связи. Продукт гена B3GAT1 является ключевым ферментом в реакции переноса глюкуронила в ходе биосинтеза углеводного эпитопа HNK-1/CD57[5].
В иммуногистохимии
В анатомической патологии эпитоп CD57, также как сходный с ним CD56, используется в дифференциальной диагностике нейроэндокринных опухолей от опухолей иного происхождения[7]. Эпитоп CD57 находится на 10-20% лимфоцитов, а также на некоторых эпителиальных, нейрональных хромаффинных клетках. На лимфоцитах эпитоп преимущественно присутствует на T-лимфоцитах и естественных киллерах и как правило находится на клетках герминальных центров лимфатических узлов, миндалин и селезёнки[8].
Повышенный уровень CD57+ клеток обнаруживается в крови больных после трансплантации, особенно трансплантации костного мозга, и больных с HIV, а также при ревматоидном артрите и аутоиммунном синдроме Фелти и при некоторых других заболеваниях[8].
Структура
Продукт гена B3GAT1 состоит из 334 аминокислот, молекулярная масса 38,3 кДа. Активный центр содержит Mn2+.
Примечания
- ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000109956 - Ensembl, May 2017
- ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000045994 - Ensembl, May 2017
- ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ 1 2 Db=gene&Cmd=ShowDetailView&TermToSearch=27087 Entrez Gene: B3GAT1 beta-1,3-glucuronyltransferase 1 (glucuronosyltransferase P) . Архивировано 29 октября 2012 года.
- ↑ Mitsumoto Y., Oka S., Sakuma H., Inazawa J., Kawasaki T. Cloning and chromosomal mapping of human glucuronyltransferase involved in biosynthesis of the HNK-1 carbohydrate epitope (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 2000. — April (vol. 65, no. 2). — P. 166—173. — doi:10.1006/geno.2000.6152. — PMID 10783264.
- ↑ Wick, Mark R. Chapter 11 – Immunohistology of the Mediastinum // Diagnostic immunohistochemistry: theranostic and genomic applications (англ.) / Dabbs, David J.. — 3rd. — Philadelphia, PA: Saunders/Elsevier, 2010. — P. 345—346. — ISBN 978-1-4160-5766-6. — doi:10.1016/B978-1-4160-5766-6.00015-7.
- ↑ 1 2 Leong, Anthony S.-Y.; Cooper, Kumarasen; Leong, F. Joel W.-M. Manual of Diagnostic Antibodies for Immunohistology (англ.). — 2nd. — London: Greenwich Medical Media, 2003. — P. 131—134. — ISBN 978-1-84110-100-2.
Литература
- Andersson B., Wentland M. A., Ricafrente J. Y., Liu W., Gibbs R. A. A "double adaptor" method for improved shotgun library construction (англ.) // Analytical Biochemistry : journal. — 1996. — April (vol. 236, no. 1). — P. 107—113. — doi:10.1006/abio.1996.0138. — PMID 8619474.
- Yu W., Andersson B., Worley K. C., Muzny D. M., Ding Y., Liu W., Ricafrente J. Y., Wentland M. A., Lennon G., Gibbs R. A. Large-scale concatenation cDNA sequencing (англ.) // Genome Research : journal. — 1997. — April (vol. 7, no. 4). — P. 353—358. — doi:10.1101/gr.7.4.353. — PMID 9110174. — PMC 139146.
- Tone Y., Kitagawa H., Imiya K., Oka S., Kawasaki T., Sugahara K. Characterization of recombinant human glucuronyltransferase I involved in the biosynthesis of the glycosaminoglycan-protein linkage region of proteoglycans (англ.) // FEBS Letters : journal. — 1999. — October (vol. 459, no. 3). — P. 415—420. — doi:10.1016/S0014-5793(99)01287-9. — PMID 10526176.
- Mitsumoto Y., Oka S., Sakuma H., Inazawa J., Kawasaki T. Cloning and chromosomal mapping of human glucuronyltransferase involved in biosynthesis of the HNK-1 carbohydrate epitope (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 2000. — April (vol. 65, no. 2). — P. 166—173. — doi:10.1006/geno.2000.6152. — PMID 10783264.
- Pedersen L. C., Tsuchida K., Kitagawa H., Sugahara K., Darden T. A., Negishi M. Heparan/chondroitin sulfate biosynthesis. Structure and mechanism of human glucuronyltransferase I (англ.) // The Journal of Biological Chemistry : journal. — 2000. — November (vol. 275, no. 44). — P. 34580—34585. — doi:10.1074/jbc.M007399200. — PMID 10946001.
- Cebo C., Durier V., Lagant P., Maes E., Florea D., Lefebvre T., Strecker G., Vergoten G., Zanetta J. P. Function and molecular modeling of the interaction between human interleukin 6 and its HNK-1 oligosaccharide ligands (англ.) // The Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — April (vol. 277, no. 14). — P. 12246—12252. — doi:10.1074/jbc.M106816200. — PMID 11788581.
- Ouzzine M., Gulberti S., Levoin N., Netter P., Magdalou J., Fournel-Gigleux S. The donor substrate specificity of the human beta 1,3-glucuronosyltransferase I toward UDP-glucuronic acid is determined by two crucial histidine and arginine residues (англ.) // The Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — July (vol. 277, no. 28). — P. 25439—25445. — doi:10.1074/jbc.M201912200. — PMID 11986319.
- Brenchley J. M., Karandikar N. J., Betts M. R., Ambrozak D. R., Hill B. J., Crotty L. E., Casazza J. P., Kuruppu J., Migueles S. A., Connors M., Roederer M., Douek D. C., Koup R. A. Expression of CD57 defines replicative senescence and antigen-induced apoptotic death of CD8+ T cells (англ.) // Blood : journal. — American Society of Hematology, 2003. — April (vol. 101, no. 7). — P. 2711—2720. — doi:10.1182/blood-2002-07-2103. — PMID 12433688.
- Jirásek T., Hozák P., Mandys V. Different patterns of chromogranin A and Leu-7 (CD57) expression in gastrointestinal carcinoids: immunohistochemical and confocal laser scanning microscopy study (англ.) // Neoplasma : journal. — 2003. — Vol. 50, no. 1. — P. 1—7. — PMID 12687271.
- Jeffries A. R., Mungall A. J., Dawson E., Halls K., Langford C. F., Murray R. M., Dunham I., Powell J. F. beta-1,3-Glucuronyltransferase-1 gene implicated as a candidate for a schizophrenia-like psychosis through molecular analysis of a balanced translocation (англ.) // Molecular Psychiatry : journal. — 2003. — July (vol. 8, no. 7). — P. 654—663. — doi:10.1038/sj.mp.4001382. — PMID 12874601.
- Chochi K., Ichikura T., Majima T., Kawabata T., Matsumoto A., Sugasawa H., Kawarabayashi N., Takayama E., Hiraide H., Seki S., Mochizuki H. The increase of CD57+ T cells in the peripheral blood and their impaired immune functions in patients with advanced gastric cancer (англ.) // Oncology Reports : journal. — 2004. — Vol. 10, no. 5. — P. 1443—1448. — doi:10.3892/or.10.5.1443. — PMID 12883721.
- Kakuda S., Shiba T., Ishiguro M., Tagawa H., Oka S., Kajihara Y., Kawasaki T., Wakatsuki S., Kato R. Structural basis for acceptor substrate recognition of a human glucuronyltransferase, GlcAT-P, an enzyme critical in the biosynthesis of the carbohydrate epitope HNK-1 (англ.) // The Journal of Biological Chemistry : journal. — 2004. — May (vol. 279, no. 21). — P. 22693—22703. — doi:10.1074/jbc.M400622200. — PMID 14993226.
- Matsubara K., Yura K., Hirata T., Nigami H., Harigaya H., Nozaki H., Fukaya T., Baba K. Acute lymphoblastic leukemia with coexpression of CD56 and CD57: case report (англ.) // Pediatric Hematology and Oncology : journal. — 2005. — Vol. 21, no. 7. — P. 677—682. — doi:10.1080/08880010490501105. — PMID 15626024.
- Ibegbu C. C., Xu Y. X., Harris W., Maggio D., Miller J. D., Kourtis A. P. Expression of killer cell lectin-like receptor G1 on antigen-specific human CD8+ T lymphocytes during active, latent, and resolved infection and its relation with CD57 (англ.) // Journal of Immunology : journal. — 2005. — May (vol. 174, no. 10). — P. 6088—6094. — doi:10.4049/jimmunol.174.10.6088. — PMID 15879103.
- Assouti M., Vynios D. H., Anagnostides S. T., Papadopoulos G., Georgakopoulos C. D., Gartaganis S. P. Collagen type IX and HNK-1 epitope in tears of patients with pseudoexfoliation syndrome (англ.) // Biochimica et Biophysica Acta : journal. — 2006. — January (vol. 1762, no. 1). — P. 54—8. — doi:10.1016/j.bbadis.2005.09.005. — PMID 16257185.
- Barré L., Venkatesan N., Magdalou J., Netter P., Fournel-Gigleux S., Ouzzine M. Evidence of calcium-dependent pathway in the regulation of human beta1,3-glucuronosyltransferase-1 (GlcAT-I) gene expression: a key enzyme in proteoglycan synthesis (англ.) // The FASEB Journal : journal. — Federation of American Societies for Experimental Biology, 2006. — August (vol. 20, no. 10). — P. 1692—1694. — doi:10.1096/fj.05-5073fje. — PMID 16807373.
- Sada-Ovalle I., Torre-Bouscoulet L., Valdez-Vázquez R., Martínez-Cairo S., Zenteno E., Lascurain R. Characterization of a cytotoxic CD57+ T cell subset from patients with pulmonary tuberculosis (англ.) // Clinical Immunology : journal. — 2006. — December (vol. 121, no. 3). — P. 314—323. — doi:10.1016/j.clim.2006.08.011. — PMID 17035093.
|
|---|
| 1-50 |
- CD1 (a-c, 1A, 1D, 1E)
- CD2
- CD3 (γ, δ, ε)
- CD4
- CD5
- CD6
- CD7
- CD8 (a)
- CD9
- CD10
- CD11 (a, b, c, d)
- CD13
- CD14
- CD15
- CD16 (A, B)
- CD18
- CD19
- CD20
- CD21
- CD22
- CD23
- CD24
- CD25
- CD26
- CD27
- CD28
- CD29
- CD30
- CD31
- CD32 (A, B)
- CD33
- CD34
- CD35
- CD36
- CD37
- CD38
- CD39
- CD40
- CD41
- CD42 (a, b, c, d)
- CD43
- CD44
- CD45
- CD46
- CD47
- CD48
- CD49 (a, b, c, d, e, f)
- CD50
|
|---|
| 51-100 |
- CD51
- CD52
- CD53
- CD54
- CD55
- CD56
- CD57
- CD58
- CD59
- CD61
- CD62 (E, L, P)
- CD63
- CD64 (A, B, C)
- CD66 (a, b, c, d, e, f)
- CD68
- CD69
- CD70
- CD71
- CD72
- CD73
- CD74
- CD78
- CD79 (a, b)
- CD80
- CD81
- CD82
- CD83
- CD84
- CD85 (a, d, e, h, j, k)
- CD86
- CD87
- CD88
- CD89
- CD90
- CD91
- CD92
- CD93
- CD94
- CD95
- CD96
- CD97
- CD98
- CD99
- CD100
|
|---|
| 101-150 | |
|---|
| 151-200 |
- CD151
- CD152
- CD153
- CD154
- CD155
- CD156 (a, b, c)
- CD157
- CD158 (a, d, e, i, k)
- CD159 (a, c)
- CD160
- CD161
- CD162
- CD163
- CD164
- CD166
- CD167 (a, b)
- CD168
- CD169
- CD170
- CD171
- CD172 (a, b, g)
- CD174
- CD177
- CD178
- CD179 (a, b)
- CD181
- CD182
- CD183
- CD184
- CD185
- CD186
- CD191
- CD192
- CD193
- CD194
- CD195
- CD196
- CD197
- CDw198
- CDw199
- CD200
|
|---|
| 201-250 | |
|---|
| 251-300 | |
|---|
| 301-350 | |
|---|
| 351-400 | |
|---|